BFA est une asbl dont la structure est déterminée par voie statutaire. Le suivi quotidien de l’organisation est assuré par la directrice (Katrien D'hooghe), ainsi que son équipe.

Tous les 3 ans a lieu la désignation d’un nouveau président (Rik Vandeputte - 2024) et d’un vice-président (Alex Van Malleghem - 2024) qui conseillent et soutiennent l’équipe en cas de besoin.

L’organe décisionnel de BFA se compose tant par le Bureau, que par l'Organe d’administration. Les administrateurs de l'Organe d’administration sont élus par l’Assemblée Générale et chaque membre ne peut y être représenté que par un seul administrateur (sauf contre-indication).

Enfin, l’Assemblée Générale désigne chaque année un commissaire qui se doit de vérifier les comptes.